Agentziak, gaur egun, ez du funts nahikorik. 2014ko hasieran, 65 milioi dolarreko defizita izan zuen. Oro har, funtsak ez dira errefuxiatuen beharrak handitzen diren neurri berean mantentzen. Horren ondorioz, UNRWAk ematen duen zerbitzuen kalitatea nabarmen jaitsi da.

UNRWAren diru-emaile handiena den AEBk 2018. urtearen hasieran funtsak kendu ondoren, Agentzia inoiz ez bezalako finantza-krisi bati aurre egin beharrean aurkitzen da.